MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Clostridium phage phiSM101 chromosome

Total Repeats: 315

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_008265	TGCT	2	8	58	65	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
2	NC_008265	T	6	6	72	77	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_008265	TTC	2	6	79	84	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4	NC_008265	CTG	2	6	102	107	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5	NC_008265	GCTATA	2	12	143	154	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
6	NC_008265	TTAC	2	8	221	228	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
7	NC_008265	GTA	2	6	248	253	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8	NC_008265	GAA	2	6	386	391	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
9	NC_008265	TA	4	8	421	428	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_008265	CATT	2	8	521	528	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
11	NC_008265	ATTTAA	2	12	529	540	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_008265	ACC	2	6	562	567	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
13	NC_008265	ATT	2	6	578	583	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_008265	TTA	2	6	641	646	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_008265	TAT	2	6	672	677	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_008265	ATT	2	6	727	732	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_008265	CAT	2	6	819	824	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
18	NC_008265	TACTT	2	10	868	877	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
19	NC_008265	T	6	6	882	887	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_008265	ATTT	2	8	898	905	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_008265	CTG	2	6	906	911	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
22	NC_008265	TTTA	2	8	916	923	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_008265	TGT	2	6	937	942	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
24	NC_008265	ATT	2	6	970	975	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_008265	CTT	2	6	1026	1031	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
26	NC_008265	TTG	2	6	1126	1131	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
27	NC_008265	TTCTCT	2	12	1134	1145	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
28	NC_008265	CTT	2	6	1146	1151	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
29	NC_008265	CAT	2	6	1218	1223	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
30	NC_008265	T	7	7	1231	1237	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_008265	T	6	6	1279	1284	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_008265	TA	3	6	1345	1350	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_008265	TAG	2	6	1359	1364	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
34	NC_008265	TTG	2	6	1390	1395	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
35	NC_008265	AATTTA	2	12	1398	1409	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_008265	ATT	2	6	1430	1435	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_008265	TCT	2	6	1454	1459	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
38	NC_008265	AT	3	6	1476	1481	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_008265	CAA	2	6	1529	1534	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
40	NC_008265	TA	3	6	1567	1572	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_008265	CCA	2	6	1658	1663	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
42	NC_008265	TAT	2	6	1758	1763	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_008265	TCT	2	6	1784	1789	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
44	NC_008265	ATT	3	9	1804	1812	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_008265	TAA	2	6	1881	1886	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_008265	TTAC	2	8	1898	1905	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
47	NC_008265	TTA	2	6	1910	1915	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_008265	TGT	2	6	1924	1929	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
49	NC_008265	C	6	6	1960	1965	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
50	NC_008265	TAT	2	6	2031	2036	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_008265	CTA	2	6	2091	2096	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
52	NC_008265	TAT	2	6	2103	2108	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_008265	GAT	2	6	2132	2137	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
54	NC_008265	ACT	2	6	2140	2145	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
55	NC_008265	CTAT	2	8	2153	2160	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
56	NC_008265	CT	3	6	2186	2191	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
57	NC_008265	TTA	2	6	2201	2206	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_008265	CTT	2	6	2218	2223	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
59	NC_008265	T	6	6	2325	2330	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_008265	AAC	2	6	2365	2370	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
61	NC_008265	TAT	2	6	2376	2381	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_008265	TCT	2	6	2387	2392	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
63	NC_008265	TTA	2	6	2495	2500	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_008265	TTA	2	6	2522	2527	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_008265	TTA	2	6	2570	2575	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_008265	TAA	2	6	2581	2586	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_008265	TAC	2	6	2611	2616	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
68	NC_008265	TAT	3	9	2667	2675	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_008265	TAA	2	6	2722	2727	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_008265	ATTT	2	8	2779	2786	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_008265	AGC	2	6	2788	2793	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
72	NC_008265	CCA	2	6	2891	2896	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
73	NC_008265	ATTTGC	2	12	2974	2985	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
74	NC_008265	AT	3	6	3000	3005	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_008265	TTA	2	6	3011	3016	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_008265	TTA	2	6	3026	3031	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_008265	T	6	6	3070	3075	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_008265	ATA	2	6	3138	3143	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_008265	GTT	2	6	3158	3163	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
80	NC_008265	CTTA	2	8	3235	3242	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
81	NC_008265	TTG	2	6	3282	3287	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
82	NC_008265	T	7	7	3423	3429	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_008265	TAT	2	6	3441	3446	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_008265	TAT	2	6	3489	3494	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_008265	TTG	2	6	3523	3528	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
86	NC_008265	TTA	2	6	3632	3637	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_008265	TAGA	2	8	3642	3649	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
88	NC_008265	AAT	2	6	3672	3677	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_008265	AGG	2	6	3735	3740	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
90	NC_008265	TTC	2	6	3757	3762	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
91	NC_008265	TCT	2	6	3779	3784	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
92	NC_008265	CTTT	2	8	3791	3798	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
93	NC_008265	TC	3	6	3808	3813	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
94	NC_008265	TTA	2	6	3839	3844	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_008265	ATT	2	6	3877	3882	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NC_008265	ATCC	2	8	3900	3907	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
97	NC_008265	TAT	2	6	3919	3924	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NC_008265	CTAT	2	8	3980	3987	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
99	NC_008265	AAGT	2	8	3989	3996	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
100	NC_008265	TC	3	6	4034	4039	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
101	NC_008265	T	6	6	4076	4081	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
102	NC_008265	TTA	2	6	4109	4114	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
103	NC_008265	TCCA	2	8	4161	4168	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
104	NC_008265	CTA	2	6	4173	4178	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
105	NC_008265	AAG	2	6	4191	4196	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
106	NC_008265	AT	3	6	4233	4238	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NC_008265	TTC	2	6	4249	4254	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
108	NC_008265	AT	3	6	4337	4342	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
109	NC_008265	CTT	2	6	4344	4349	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
110	NC_008265	CTA	2	6	4350	4355	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
111	NC_008265	TCA	2	6	4358	4363	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
112	NC_008265	CTT	2	6	4374	4379	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
113	NC_008265	AG	3	6	4393	4398	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
114	NC_008265	CT	3	6	4424	4429	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
115	NC_008265	TAA	2	6	4492	4497	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
116	NC_008265	AC	3	6	4506	4511	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
117	NC_008265	A	7	7	4523	4529	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
118	NC_008265	TAT	2	6	4530	4535	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
119	NC_008265	T	6	6	4554	4559	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
120	NC_008265	A	6	6	4583	4588	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
121	NC_008265	T	6	6	4600	4605	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
122	NC_008265	TTA	2	6	4613	4618	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
123	NC_008265	CTT	2	6	5023	5028	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
124	NC_008265	T	6	6	5037	5042	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
125	NC_008265	CTT	2	6	5390	5395	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
126	NC_008265	TCC	2	6	9647	9652	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
127	NC_008265	CTTT	2	8	10897	10904	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
128	NC_008265	T	6	6	10902	10907	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
129	NC_008265	CTA	2	6	10993	10998	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
130	NC_008265	T	6	6	11005	11010	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
131	NC_008265	T	7	7	11019	11025	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
132	NC_008265	CTT	2	6	11030	11035	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
133	NC_008265	AGA	2	6	11040	11045	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
134	NC_008265	A	6	6	11060	11065	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
135	NC_008265	AAT	2	6	11081	11086	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
136	NC_008265	CTT	2	6	11105	11110	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
137	NC_008265	TAA	2	6	11132	11137	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
138	NC_008265	T	8	8	11165	11172	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
139	NC_008265	TCA	2	6	11218	11223	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
140	NC_008265	TAAA	2	8	11237	11244	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
141	NC_008265	ATTT	2	8	11256	11263	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
142	NC_008265	A	6	6	11642	11647	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
143	NC_008265	ATT	2	6	12056	12061	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
144	NC_008265	TAA	2	6	12074	12079	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
145	NC_008265	TA	3	6	15915	15920	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
146	NC_008265	CCT	2	6	15924	15929	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
147	NC_008265	TAA	2	6	15966	15971	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
148	NC_008265	AT	3	6	16001	16006	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
149	NC_008265	GTA	2	6	16018	16023	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
150	NC_008265	TAT	2	6	16029	16034	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
151	NC_008265	TAA	2	6	16035	16040	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
152	NC_008265	A	7	7	16053	16059	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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155	NC_008265	A	7	7	18397	18403	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
156	NC_008265	A	6	6	18462	18467	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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297	NC_008265	TA	3	6	37484	37489	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
298	NC_008265	ATT	2	6	37541	37546	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
299	NC_008265	TTGAAT	2	12	37552	37563	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
300	NC_008265	ACC	2	6	37564	37569	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
301	NC_008265	AAT	2	6	37598	37603	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
302	NC_008265	AAAAT	2	10	37643	37652	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
303	NC_008265	CCA	2	6	37653	37658	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
304	NC_008265	ATTT	2	8	37724	37731	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
305	NC_008265	GTT	2	6	37746	37751	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
306	NC_008265	TTCCAT	2	12	37756	37767	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
307	NC_008265	TTA	2	6	37866	37871	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
308	NC_008265	TTA	2	6	37896	37901	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
309	NC_008265	TGTTTT	2	12	37910	37921	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
310	NC_008265	ATTTT	2	10	37953	37962	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
311	NC_008265	T	6	6	37959	37964	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
312	NC_008265	AT	3	6	37966	37971	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
313	NC_008265	TAT	2	6	37999	38004	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
314	NC_008265	TGT	2	6	38009	38014	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
315	NC_008265	ATT	2	6	38054	38059	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.